Spis treści
31 kontakty: Białka, Białka błonowe, BLAST, Chromofor, Człowiek rozumny, Domena białka, Eukarionty, Ewolucja biologiczna, Ferredoksyna, Fikobilisomy, Fikocyjanina, Gatunek (biologia), Harmonijka beta, Helisa alfa, Hem (biochemia), Hemoglobina, Hierarchia, Komórka, Koniec N, Ligand (chemia), Mostek dwusiarczkowy, Ostatni wspólny przodek, Peptydy, Proteazy, Proteazy serynowe, Protein Data Bank, Sekwencja aminokwasów, Struktura drugorzędowa białka, Struktura trzeciorzędowa białka, Trypsyna, Układ odpornościowy.
Białka
zwinięciu białka (kolor czerwony – reszty kwasowe, niebieski – reszty zasadowe, zielony – reszty polarne, biały – reszty niepolarne) mioglobiny Białka, proteiny – wielkocząsteczkowe biopolimery o masie cząsteczkowej od ok.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Białka
Białka błonowe
Białka błonowe – białka związane ze strukturąbłony biologicznej.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Białka błonowe
BLAST
BLAST (ang. Basic Local Alignment Search Tool) – narzędzie bioinformatyczne (algorytm) służące do lokalnego przyrównywania sekwencji aminokwasów białek lub nukleotydów DNA.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i BLAST
Chromofor
Chromofor – atom, jon, cząsteczka lub inne indywiduum chemiczne, w obrębie którego lub której zachodząprzejścia elektronowe odpowiadające za pasmo widmowe.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Chromofor
Człowiek rozumny
Dawid'', 1501–1504; wizerunek mężczyzny ''Homo sapiens'' Człowiek rozumny (Homo sapiens) – gatunek ssaka naczelnego, jedyny występujący współcześnie przedstawiciel rodzaju Homo.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Człowiek rozumny
Domena białka
Domena białka – fragment cząsteczki białka wyodrębniony ze względu na samoistnązdolność zachowania swojej struktury trójwymiarowej niezależnie od całej cząsteczki.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Domena białka
Eukarionty
Eukarionty, eukariota, eukarioty, organizmy eukariotyczne (Eukaryota, Eukarya), określane też jako jądrowce, jądrowe, organizmy jądrowe, karioty, kariota (Karyobionta) – organizmy zbudowane z komórek posiadających jądro komórkowe z chromosomami, co jest jednym z elementów odróżniających je od prokariontów.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Eukarionty
Ewolucja biologiczna
Ewolucja biologiczna, ewolucja organiczna – zmiany cech całych grup organizmów następujące z biegiem pokoleń.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Ewolucja biologiczna
Ferredoksyna
Centrum 2Fe-2S Ferredoksyna, Fd – białko stromy chloroplastów o masie 12 kDa, zawierające grupę prostetyczną2Fe-2S.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Ferredoksyna
Fikobilisomy
Struktura fikobilisomu Fikobilisomy – struktury białkowe uczestniczące w procesie fotosyntezy, pełniące funkcje anten absorbujących światło w zakresie 470-650 nm.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Fikobilisomy
Fikocyjanina
Wzór strukturalny fikocyjanobiliny Fikocyjanina – niebieski barwnik, występujący u krasnorostów, kryptofitów i sinic.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Fikocyjanina
Gatunek (biologia)
rodzaj i '''gatunek''' Gatunek – w biologii podstawowa jednostka taksonomiczna, jedna z kategorii systematycznych oraz jednostka różnorodności biologicznej.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Gatunek (biologia)
Harmonijka beta
Przykładowa antyrównoległa harmonijka beta zbudowana z 4 łańcuchów polipeptydowycha – widok z góry, b – widok z boku zakrętami beta Harmonijka beta (beta-kartka) – jedna z możliwych struktur drugorzędowych białka (obok m.in. helisy alfa).
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Harmonijka beta
Helisa alfa
Boczny widok na α helisę Helisa alfa – struktura drugorzędowa białka (tak jak i harmonijka beta), stabilizowana przez wiązania wodorowe.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Helisa alfa
Hem (biochemia)
Hem B Delokalizacja wiązań w cząsteczce hemu B model czaszowy) model pręcikowo-kulkowy) Hem, żelazoporfiryna – grupa prostetyczna wielu enzymów, występująca między innymi w hemoglobinie, mioglobinie oraz cytochromach.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Hem (biochemia)
Hemoglobina
Wizualizacja cząsteczki hemoglobiny. Cztery zasocjowane podjednostki, z których każda zawiera cząsteczkę hemu (zaznaczonąna zielono). Nie pokazano grup bocznych aminokwasów, a tylko konformację łańcuchów peptydowych – tzw. model wstęgowy Miejsce i odsetek syntezy łańcuchów hemoglobiny w życiu pre- i postnatalnym Krzywa wysycenia hemoglobiny w zależności od ciśnienia cząstkowego tlenu.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Hemoglobina
Hierarchia
Hierarchia (z gr. „urząd najwyższego kapłana”).
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Hierarchia
Komórka
DNA (zielony), obraz mikroskopowy Komórka (łac. cellula) – najmniejsza strukturalna i funkcjonalna jednostka organizmów żywych zdolna do przeprowadzania wszystkich podstawowych procesów życiowych (takich jak przemiana materii, wzrost i rozmnażanie).
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Komórka
Koniec N
C-końcowa reszta aminokwasowa z wolnągrupąkarboksylowąKoniec N, koniec aminowy (żargonowo: N-koniec) – koniec polipeptydowego łańcucha zawierający grupę aminową(lub). Na drugim końcu łańcucha, nazywanym końcem C lub końcem karboksylowym, znajduje się grupa karboksylowa.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Koniec N
Ligand (chemia)
Ligand, addend – atom, cząsteczka lub anion w związkach kompleksowych, który jest przyłączony bezpośrednio do atomu centralnego lub kationu centralnego, zwanego centrum koordynacji albo rdzeniem kompleksu.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Ligand (chemia)
Mostek dwusiarczkowy
Mostek dwusiarczkowy (disiarczkowy), wiązanie dwusiarczkowe, mostek disulfidowy – mostek utworzony przez dwa atomy siarki (-S-S-) dwóch cząsteczek tego samego związku chemicznego lub różnych związków.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Mostek dwusiarczkowy
Ostatni wspólny przodek
Ostatni wspólny przodek − ostatni organizm, od którego pochodząwszystkie organizmy z danej grupy (kladu).
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Ostatni wspólny przodek
Peptydy
Oligopeptydy Peptydy (gr. πεπτίδια, strawne) – organiczne związki chemiczne, amidy powstające przez połączenie dwóch lub więcej cząsteczek aminokwasów wiązaniem peptydowym.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Peptydy
Proteazy
Proteazy, peptydazy, enzymy proteolityczne (EC 3.4) – podklasa enzymów z klasy hydrolaz katalizujących proteolizę, czyli hydrolizę wiązań peptydowych.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Proteazy
Proteazy serynowe
Proteazy serynowe (EC 3.4.21) – podpodklasa enzymów, należąca do klasy hydrolaz i podklasy proteaz.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Proteazy serynowe
Protein Data Bank
Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Protein Data Bank
Sekwencja aminokwasów
Schemat I, II, III i IV-rzędowej struktury białek Sekwencja aminokwasów, struktura pierwszorzędowa białka, struktura pierwotna białka – liniowy układ aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym, połączonych ze sobąwiązaniami peptydowymi pomiędzy grupąα-karboksylowąjednego aminokwasu, a α-aminowąaminokwasu kolejnego.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Sekwencja aminokwasów
Struktura drugorzędowa białka
Struktury drugorzędowe harmonijek beta. Struktura drugorzędowa białka – jeden z poziomów organizacji cząsteczki białka, który opisuje jej budowę.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Struktura drugorzędowa białka
Struktura trzeciorzędowa białka
Struktura trzeciorzędowa ludzkiego białka PDB: 2GYR Struktura trzeciorzędowa białka – poziom organizacji, na którym można opisać budowę białka.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Struktura trzeciorzędowa białka
Trypsyna
Struktura trypsyny Trypsyna (EC 3.4.21.4) – enzym trawienny wytwarzany przez część zewnątrzwydzielniczątrzustki.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Trypsyna
Układ odpornościowy
skaningowego mikroskopu elektronowego) Układ odpornościowy, układ immunologiczny – układ narządów umożliwiających działanie mechanizmom odporności.
Zobaczyć Structural Classification of Proteins database i Układ odpornościowy